Scenariul detaliat de Kotaku incepe imediat dupa evenimentele din Modern Warfare 2, in Statele Unite asediate de Rusia. Capitanul “Soap“ McTavish, capitanul Price si informatorul lor Nikolai sunt raniti si fug din tara pentru a se ascunde undeva in India. Dar ascunzatoarea lor este descoperita, ergo, oamenii scapa la bordul unui elicopter. Actiunea revine la New York, in Manhattan, unde rusii lanseaza un atac asupra orasului prin intermediul flotei lor ce se afla pe raul Hudson. Noi il vom controla in acest moment pe Frost, un soldat din trupele Delta care este sub comanda lui Sandman si care trebuie sa securizeze bursa din New York pentru ca americanii sa poată riposta. Odata ce am indeplinit acest obiectiv, jocul ne intoarce in timp cu sase luni…
 
De data aceasta, ne aflam in avionul presedintelui rus care se afla in drum spre Statele Unite unde trebuie sa semneze un tratat de pace cu SUA. Totul este sub control in tara in care totul se vrea sub control, dar niste pirati ai aerului aflati sub comanda lui Makarov incearcă sa il rapeasca pe presedinte si pe fata lui. In acest moment, noi vom controla un agent rus si vom incerca sa salvam situatia: deh, shit happens, si fata presedintelui reuseste sa scape dar presedintele, ba! Situatia este cu atat mai disperata cu cat Makarov vrea sa smulga de la presedinte codul pentru a lansa un atac masiv asupra Statelor Unite.
 
Trecem in Africa, unde Price, Soap si Yuri il caută pe imputitul de Makarov. Un comerciant de arme din Africa de Sud le sopteste ca acesta vrea sa puna mana pe niste arme chimice. Cei trei vor incerca sa zadarniceasca livrarea acestor arme in Sierra Leone asa ca…
 
… ne trezim la Londra, unde jucam cu un agent al Majestatii Sale, care va incerca sa intercepteze sosirea armelor chimice taman in portul capitalei Regatului Unit. Urmeaza nitel pac-pac si urmariri prin metroul londonez. Acest capitol din Modern Warfare 3 se incheie cu un atac asupra parlamentului cu explozibili si arme chimice. In acelasi timp, alte orase europene sunt atacate de teroristi, ergo Armata Rusa are un motiv serios sa invadeze Batranul Continent…
 
Unde mai vreti sa mergem acum? Aaa, da, ar fi timpul sa ne intoarcem in Africa, unde ii regasim pe Yuri, Price si Soap care au descoperit ca informatorul lor este un trădător. Cei trei purced spre Mogadishu (Somalia), unde cred ca se ascunde ticalosul. Dar, afla pe parcurs ca mana dreapta a lui Makarov, Volk, este la Paris. Din pacate, nu au timp sa faca turism in Orasul Luminilor, caci trebuie sa dea o fuga la Hamburg. La bordul unui tanc, vom lupta contra rusilor. Orasul cade insa in mainile acestora, asa ca ne continuam drumul catre Paris. Cu Frost, ajutat de trupele speciale franceze (GIGN), incercam sa dam de Volk care pare sa se ascunda prin canalizarea orasului. Volk este capturat si marturiseste ca Makarov are o intalnire importanta la Praga.
 
Yuri, Price si Soap sunt trimisi in misiune la Praga, unde trebuie sa-l captureze pe acesta, dar, evident, rateaza tinta si trebuie sa fuga din oras. Cei trei merg spre cartierul general al lui Makarov, aflat intr-un castel din muntii Cehiei, unde trebuie sa adune informatii. Ei descopera ca individul l-a capturat pe presedintele Rusiei, si ca fiica acestuia s-ar afla la Berlin. Ajungem acolo cu Frost, care trebuie sa o gaseasca pe fata, sa o apere cu pretul vietii dar acesta rateaza glorios si oamenii lui Makarov pun mana pe ea. Cat de incapabili pot să fie baietii buni uneori…
 
Frost ajunge la Moscova, la Kremlin, unde elibereaza ostatecii, dar Makarov reuseste iar sa scape. Price, Yuri si Sandman ii gasesc urma pe undeva prin Duabi si… il lichideaza! Uraaa! Stati asa, ca nu se termina… Se pare ca mai exista o misiune (după credits) unde ajungem in New York, iar orasul este in ruina…